MBR膜生物反應器從本質上仍是物理過濾，因而MBR發生的很大的問題仍然與過濾相關。也就是說在運轉中簡單呈現的問題主要是膜通量的下降，導致無法堅持滿足的產水才能，形成出水水量銳減，體系無法經過滿足的水量，形成體系處理才能下降，污水提高泵緊縮產值，形成廠外污水停留溢流等事端發生。從這個底子的原因上來看，在污水廠的調試以及運轉期間會遇到MBR問題，都是以MBR的阻塞為表征呈現的，可是終究的表征結果是MBR阻塞，可是阻塞的原因是由許多方面發生的，從一些污水廠的運轉狀況去看，對MBR的運轉形成影響的主要有：

　?。?、活性污泥的原因：因為活性污泥中的微生物濃度缺乏，無機鹽類或許無機物較多；微生物種群呈現異常狀況（絲狀菌脹大和生物泡沫等），以及微生物外表過多的EPS導致的MBR膜阻塞，性污泥中的細胞外物質EPS黏度高，在水溫水質發生顯著的改變的一起，會呈現EPS的改變，EPS對MBR的污堵問題也遭到漸漸的變多的研究者的重視，導致MBR膜通量快速下降。

　　當活性污泥發生很多生物泡沫的毛病時（生物泡沫較多的時分，一般會有活性污泥的很多丟失），或膜阻塞而導致MBR池的活性污泥溢出等狀況。

　?。?、進水雜物問題：有些污水廠沒有運用或許運用不當１ｍｍ左右的精密格柵去除進水中的懸浮雜物，有些污水廠在活性污泥培育期間，為了快速添加生物池內的活性污泥濃度，會選用接種污泥直接投加到MBR前端的生物池內，這部分未經膜格柵過濾的污泥會導致膜阻塞，乃至一些鋒利的物體形成MBR膜的破損和開裂。

　?。?、風機問題：因為膜擦拭風機的規劃選型不合理，導致膜擦拭進程中過量的充氣或充氣缺乏等狀況呈現，形成因鼓風機原因導致MBR膜外表的污泥阻塞，過量的曝氣也簡單形成活性污泥的過度充氧，不管選用內回流和外回流都會對除磷脫氮形成必定的影響。

　?。?、污水水質問題：污水中的硬度或含鹽量過高，在膜外表堆積，對膜發生硬度的污堵狀況，形成膜通量下降的狀況，污水廠在經過酸浸泡清洗后，把這部分廢液排回到污水廠的污水管網從頭回到污水提高井內，一部分鈣鎂離子結合到活性污泥中跟著剩下污泥堆積排出體系，一部分仍回到污水中重復對膜進行堆積污堵。

　?。?、除磷劑的效果：化學除磷劑的很多運用也使部分的無機鹽類堆積到MBR膜外表，對膜外表形成化學污染，除磷劑中的化學離子堆積在MBR外表，形成MBR的阻塞，有必要進行酸浸泡清洗

　　6、滲漏對出水水質的影響：膜絲經過一段時間的運用，以及離線清洗進程中的不正確的整理雜物的進程會將膜絲扯斷和膜產水管聯接處開裂，活性污泥的混合液會經過這些途徑進入到產水泵內，抽升到后續處理構筑物內，形成對出水水質的影響，相當于過濾的走漏問題